很多原因可以导致不合理用药。另外，不同文化背景的人以不同方法看待药物，也可以影响药物的使用。
导致不合理用药的主要动因可分为：来自患者的、来自处方医生的、来自工作地点的、来自包括生产厂家影响在内的药品供应系统的因素、来自法规的因素、来自药物的正确的、错误的信息因素，以及以上几种因素之和。
（1）患者方面：错误的药物信息、信任被误导、不恰当要求。
（2）医生方面：缺少教育和培训、角色不适当、缺少客观的药物信息、经验缺乏、药物疗效的认识被错误引导。
（3）医疗机构方面：患者太多、开处方的压力、化验室能力不足、人手不足。
（4）药物供应系统方面：不可靠的供应商、药品短缺、供应过期药物。
（5）药品法规方面：处方药未正式注册、法规执行不力。
（6）企业方面：推销活动、误导消费者。
所有这些因素均受全球和所在国改革的影响。例如：原先在非洲国家频繁使用的注射给药方法，因害怕艾滋病而减少了使用。但有些国家，注射的使用率依然很高，原因在于医生想当然地认为注射能提高患者的满意度，患者也总是希望尽可能地采用注射。